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RGD點擊化學PEG:疊氮Azide修飾色氨酸多肽/糖肽/四肽-多肽新品
瑞禧生物小編分享疊氮Azide修飾色氨酸多肽/糖肽/四肽-多肽新品,一起看看吧:
在丙氨酸二肽側(cè)鏈上引入疊氮基,在紅外光譜空白區(qū)域?qū)崿F(xiàn)分子動態(tài)結(jié)構(gòu)監(jiān)測并探究疊氮基對二級結(jié)構(gòu)的影響。對Aβ37-42肽鏈進行疊氮基修飾,在實現(xiàn)特定位點光譜監(jiān)測的同時探索疊氮基對其構(gòu)象分布的影響。
研究結(jié)果表明:酰胺單元與溶劑間形成較強的氫鍵作用,傾向形成較為伸展的構(gòu)象,丙氨酸二肽分子的構(gòu)象分布區(qū)域在疊氮基的引入前后沒有發(fā)生改變,對處于代表性的特征構(gòu)象的分子開展量子化學計算,研究多肽骨架酰胺-Ⅰ帶對分子結(jié)構(gòu)的敏感性,同時引入在光譜空白區(qū)域具有特征吸收的疊氮基,借助其振動模式實現(xiàn)對模型二肽分子的結(jié)構(gòu)監(jiān)測。
以疊氮基丙氨酸二肽分子為研究對象,基于電勢、電場、電場梯度三種形式下用于描述溶劑效應構(gòu)建的靜電頻率轉(zhuǎn)換圖,實現(xiàn)了氣相振動吸收頻率到溶液相的轉(zhuǎn)化,為溶液相中小分子探針頻率的預測奠定了基礎。
將疊氮基探針應用于Aβ37-42多肽分子體系,探究疊氮基引入對體系的影響。
分子動力學模擬結(jié)果表明:在Aβ37-42多肽分子中引入疊氮基,分子疏水性增加,分子內(nèi)氫鍵作用增強,分子形成疏水空腔的幾率增大;與此同時,開展副本交換分子動力學模擬,為增加多肽分子構(gòu)象的采樣效率提供了可能。
基于分子動力學模擬,得到了不同二肽分子溶液相中結(jié)構(gòu)布居特性,并結(jié)合量化計算構(gòu)建疊氮基頻率圖,利用模擬得到紅外光譜并實現(xiàn)了對分子結(jié)構(gòu)的指認。為進一步揭示Ap多肽分子聚集機制以及實現(xiàn)溶液相中分子動態(tài)結(jié)構(gòu)監(jiān)測提供了理論依據(jù)。
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